面向国家和陕西省社会经济发展对微生物学的重大需求，重点致力于秦巴山区和西北极端环境特色微生物资源、微生物与生态环境、食品安全及健康等相关基础、应用基础及公益性研究，开展为支撑生物技术相关行业可持续发展的共性关键技术研究及储备性前沿技术探索，努力建成拥有良好源头创新能力和有序运行的现代微生物学科研机构。