近日，陕西省微生物研究所甄丽莎课题组的王艳副研究员在《Frontiers in Plant Science》（JCR Q1，IF5.9 Top期刊）发表题为“Multi-omics analysis reveals associations among endophytic microbiome shifts, host transcriptional responses, and metabolic variation across variegated leaf sectors of Aspidistra elatior”研究论文，该研究以自然叶斑变异的一叶兰为对象，整合16S/ITS扩增子测序、转录组与广靶LC-MS/MS代谢组，揭示了叶内微环境异质性下的微生物—宿主—代谢协同变化。

本文对一叶兰（Aspidistra elatior）叶内微生物组、转录组与代谢组的整合分析显示，相邻叶区之间存在显著的分子与微生物异质性。与邻近绿叶区（SG）相比，褪绿斑点区（SS）呈现出区室关联的细菌类群特征，且多样性更低，而真菌群落组成在各叶区间则保持相对稳定。这些细菌群落差异与宿主胁迫防御相关的转录特征相吻合，同时伴随多种特化代谢物——尤其是生物碱、黄酮类和酚酸——的积累增加。本研究在单叶尺度解析了上述变化，将局部叶斑变异置于更广阔的“微生物组—宿主—代谢物”关联框架下，揭示了斑点区是空间分化的特殊生物微环境。

该研究获得陕西省科学院科技计划项目（2023K-31）经费支持，体现了陕西省微生物研究所所在植物内生微生物与宿主互作方向上的积累。对空间明确的叶内微环境中微生物谱系、转录状态与次生代谢在区位尺度的研究，为“植物-微生物”互作提供了新视角，也为秦岭特色植物资源研究补充了新思路。