农业与环境微生物研究中心主要紧密围绕陕西农业生产过程中农药化肥过量使用、土壤环境污染严重和珍稀食药用菌适栽品种缺乏、生产技术标准化程度较低等方面的技术难题，应用微生物技术开展相关研究工作，攻克农业生产和环境治理等方面的关键核心技术，开发农业微生物新产品和新技术。主要研究方向为：农作物病害的生物防治技术研究及生物农药、生物肥料的研发；环境污染评价及生物修复研究；农产品深加工及农业废弃物资源化利用；珍稀食药用菌品种选育、标准化生产技术研究与高值化产品开发。已建成了陕西省省级县域科技创新试验示范站1个。

　　目前，中心有固定人员19人，其中研究员3人，副研究员8人，博士6人，硕士12人；陕西省“三五人才”1人，享受陕西省“三秦人才津贴”1人，陕西省“三区人才”4人，陕西省科技特派员4人，陕西省农用微生物科技产业技术创新战略联盟专家1人。

　　近年来，中心科研人员承担省部级、厅局级等课题100余项。研究成果获省部级、地市级奖9项，在国内外学术期刊发表论文近200篇，其中SCI及EI论文34篇，中文核心论文159篇，出版专著5部，授权国家发明专利30余件，制定地方标准15部，培育食药用菌新品种2个，完成科技成果转化1项。